办公室：协助局领导负责机关日常工作，协调机关党务、政务、事务工作；负责局机关会议的组织安排，综合材料的起草，综合调研、文书档案管理、机要保密、督查、信息、信访、机关财务、安全保卫等工作；落实老干部生活待遇等工作；负责全旗教育业务目标考核和所属单位计划生育工作。
协助局领导负责制定全旗教育事业发展规划和计划；结合我旗围封转移、结构调整、城镇化三大战略，研究和审定全旗各级各类学校设置，提出学校布局和教育结构调整的意见；指导全旗教育系统精神文明建设工作、统战工作、青年团、少先队工作。
　　人事股：负责所属二级单位机构编制、人事、老干部工作及领导班子的实绩目标考核工作；负责指导全旗学校人事制度改革；加强人才培养、使用、引进工作，根据干部考核管理权限范围，负责二级单位领导班子建设、培养、考核、选拔、监督、管理工作；规划指导教师管理、教育行政干部队伍建设工作；负责教师资格认定工作；负责教师专业技术职务评审工作；负责师范类高等学校、中等师范学校毕业就业指导及推荐工作；负责教育科技外事工作；负责教育系统知识分子工作；负责全旗教职工的表彰工作。负责全旗教育行政干部和中小学校长培训的组织工作和组织实施中小学教师的继续教育工作；负责制定全旗汉语言文字工作的长期规划和计划，协调、指导和监督检查汉语言文字规范和标准应用情况，面向社会指导推广普通话工作。
　　计财股：负责全旗教育系统的统计、分析工作；负责教育基建计划编制和实施，编制教育经费预算方案和各项教育经费的分配、管理、使用；负责所属单位的财务管理和国有资产管理工作；负责全旗教育设备的装备工作；制定全旗勤工俭学发展规划和年度计划，指导检查勤工俭学工作，审定旗级校办产业，传递经济技术信息。
　　教育股：制定全旗基础教育发展规划和计划；综合管理全旗基础教育、特殊教育、扫盲教育，并负责检查评估工作；参与对青少年校外教育机构的管理和指导；指导基础教育改革和课程改革；负责全旗中小学校、幼儿园教材、教辅用书和学具的管理工作；负责中小学义务教育和素质教育的组织实施和管理工作。
　　制定全旗职业教育和成人教育发展规划和计划；管理全旗职业教育教学工作；负责对职业学校管理、检查、评估工作；负责全旗职业学校教材建设和管理；指导职业学校德育；管理全旗成人教育，负责全旗农牧民教育和职工教育工作的指导；采取有效措施，面向农村、牧区和现代服务业，组织开展职业技能培训工作；提高劳动者素质。根据我旗产业结构调整，培养实用型人才，提高农牧民的科技文化素质，培养科技带头人和技术骨干。
　　制定民族教育发展规划和计划，协调制定有关落实民族教育优先、重点发展的政策措施；依法保障少数民族青少年受教育的权利，依法进行民族教育的改革和发展，培养实用型人才，为农牧业现代化和牧区城镇化服务；负责对民族学校的管理、检查、评估工作；指导民族语言、文字的教育教学和应用工作，指导民族中小学教育教学改革、民族教育科研和民族教育协作工作；负责民族中小学义务教育实施情况的监督管理工作。

体卫艺股：制定全旗学校体育、卫生、艺术教育规划和计划；指导学校体育、卫生健康、艺术教育和信息技术教育工作，并负责管理检查评估工作；组织并指导各类学校学生体育竞赛和艺术教育活动；指导学校体育、卫生、艺术教育基础设施建设、建材建设和专业师资培训；指导并协调学校国防教育和学生军训工作。

助学管理中心：具体落实中央、自治区制定的各项学生资助政策措施，完成上级有关部门布置的专项工作，开展资助政策宣传、法律咨询和信访工作；负责组织协调普通高校、高等职业学校和中等职业学校家庭经济困难学生资助工作；组织落实全盟农村牧区户籍困难家庭和城镇低保户家庭子女高中阶段补助政策；负责全旗公办民族中小学助学金享受范围、条件、标准及评定办法的制定和日常管理、监控；负责各级财政安排的国家助学贷款贴息资金和风险补偿专项资金的审核、管理和拨付；负责各级财政安排的各类大学生救助资金的审核、管理和拨付；负责社会团体、个人对全旗教育系统助学资金的统筹和使用；监督落实生态恢复禁牧区牧民子女教育补助政策；负责协调义务教育经费保障机制改革政策的落实；建立完善全旗助学信息管理系统和统计监测体系；检查各项资助经费使用情况。
　　招生办：负责组织实施全旗各类教育的招生考试工作。宣传贯彻国家、自治区、锡盟关于各类招生考试工作的方针、政策，按照各项规定，严格组织实施高中会考、自学考试、成人招生的报名、考试工作；负责一年一度的大中专和普高职高招生的报名考试工作；搞好高中学籍管理工作。
　　教育督导室（挂阿巴旗教育督导办公室牌子）：
代表旗政府依法监督、检查苏木镇人民政府、教育行政部门和全旗各级各类学校贯彻教育方针、政策、法规的情况；指导苏木镇人民政府教育督导工作；负责各类教育的检查、评估、验收工作；负责对其它有关教育工作的专项督查；负责教育督导的日常工作和上级教育督导机构交办的其他事宜。

行政监察室：协助局领导负责教育系统综合治理、党风廉政建设；指导全旗教育系统行风建设；负责全旗教育政策法规建设工作，制定教育系统“普法”和依法治教长期规划和年度计划并组织实施；负责本系统财务收支及有关经济活动的内部审计监督；治理中小学乱收费；负责审核旗教育局出台的政策法规文件和重大决定；负责教育行政执法监察、行政复议工作；负责全旗教育政策法规建设情况的调研。

教育工会：负责全旗教育工会工作；指导所属学校、二级单位教育工会工作；负责机关基层教育工会和妇联工作；组织落实上级工会和同级党组织的工作部署，指导学校教代会建设，代表和维护教职工的合法权益。